当前位置:首页 > 外汇资讯 > 正文内容

王炸开源!谷歌开源诺奖化学模型Alphafold-3,一夜改变世界!

激石外汇2024-11-12 11:59:42外汇资讯102

激石Pepperstone(http://www.paraat.net/)报道:

今天凌晨,谷歌终于开源了万众期待的蛋白质预测模型——AlphaFold-3!

上个月,谷歌DeepMind联合创始人兼首席执行官Demis Hassabis能拿下诺贝尔化学奖,靠的就是AlphaFold-3,足以看出这个模型的含金量。

全球顶级科学期刊《Nature》也进行了重磅推荐,这将对全球科研领域产生重大影响,生物、化学、医药的科学家们可以在本地部署AlphaFold-3,可以极限缩短新药、疫苗等研发进程。

都说AI造福全人类,而医药、科研两大领域就是最重要的应用场景之一,这也是为什么AlphaFold-3能获得诺贝尔奖的原因。

网友们见到这个模型开源,直接忍不住爆粗口了!

AlphaFold-3能开源,可太Amazing了。

太棒了。迫不及待想看到更高水平的生物模拟。

谷歌伟大的举措。迫不及待想看看这会对生命科学产生什么影响。

令人难以置信的消息!AlphaFold-3的开源可能会成为科学发现的颠覆者。迫不及待想看到它在蛋白质研究中激发的突破!

谷歌能分享这个太棒了!这真的能拯救生命。

谷歌本次开源AlphaFold-3模型非常非常低调,甚至都没有发布一篇新闻,只是在原来文章上进行了一段很小的文字说明:

2024年11月11日更新,我们已发布了AlphaFold 3的模型代码和权重供学术用途,以帮助推动科学研究。

AlphaFold-3的主要功能包括,能够对多种生物分子的结构进行预测,涵盖蛋白质、核酸(包括 DNA 和 RNA)、小分子、离子以及修饰残基等几乎所有在蛋白质数据库(PDB)中存在的分子类型。

在蛋白质结构预测方面,AlphaFold 3 展现出了极高的准确率,在预测蛋白质单体结构时,能够准确地确定蛋白质的三维折叠方式,包括二级结构α螺旋、β折叠等精确位置和走向,以及三级结构中各个结构域的相对位置和取向。

AlphaFold 3 在处理复杂结构方面表现出色,能够应对具有大量残基和多种分子组成的生物分子复合物。例如,在预测由数千个残基组成的蛋白质核酸复合物结构时,它可以有效地整合蛋白质和核酸分子的信息,准确地构建出整个复合物的三维结构模型。

对于具有高度对称性或重复结构单元的复合物,如核小体等,AlphaFold 3 也能够准确地捕捉到其结构特征,包括组蛋白与 DNA 的相互作用、核小体之间的排列方式等

在药物研发领域,AlphaFold 3可以帮助研究人员快速筛选潜在的药物靶点,通过预测靶点蛋白的结构,揭示其可能的活性位点和结合口袋,为药物设计提供重要的结构基础。

在药物分子设计阶段,AlphaFold 3 能够预测药物分子与靶点蛋白的结合模式,评估药物分子的亲和力和特异性,从而指导药物化学家进行分子优化,提高药物的疗效和安全性。

同时可以对药物分子与靶点蛋白复合物结构的准确预测,帮助研究人员理解药物作用机制,预测药物的副作用和耐药性机制,为药物研发的各个阶段提供关键的结构信息支持。

模型架构方面,AlphaFold 3在AlphaFold 2的基础之上进行了重大更新。尤其是引入了Pairformer模块替代原有的Evoformer模块,AlphaFold 3显著减少了多重序列比对(MSA)的处理量,使得模型能够更加专注于学习分子间相互作用的关键特征。

这一变化不仅提高了计算效率,更重要的是,它赋予了模型更强的泛化能力,使得AlphaFold 3能够在处理各类生物分子时都能保持高水平的准确性。

AlphaFold 3还通过引入扩散模块,直接预测原子坐标的创新设计,进一步增强了模型的功能。传统的结构预测方法往往依赖于氨基酸特定框架或侧链扭转角来进行预测,这在一定程度上限制了模型处理不同分子类型的能力。而AlphaFold 3的扩散模块直接操作于原子坐标层面,采用了一种更加直观且物理上更为合理的建模方式。

这种方法不仅简化了模型架构,避免了对复杂规则的依赖,还使得AlphaFold 3能够无缝处理各种类型的生物分子,无论是蛋白质、DNA、RNA还是小分子配体,都能提供精准的结构预测结果。

此外,AlphaFold 3在训练方法上也进行了重要的改进。通过采用跨蒸馏技术,AlphaFold 3能够利用由AlphaFold-Multimer v.2.3等高性能模型生成的大规模伪标签数据进行训练。这种策略不仅解决了高质量训练数据不足的问题,还进一步提升了模型的鲁棒性和泛化能力。

经过这样的训练流程后,AlphaFold 3不仅在标准测试集上表现出色,还能很好地应对那些罕见或复杂的生物分子复合体结构预测任务,显示出其强大的适应性和可靠性。

实验结果表明,经过这样的训练流程后,AlphaFold 3不仅在标准测试集上表现出色,还能很好地应对那些罕见或复杂的生物分子复合体结构预测任务,显示出其强大的适应性和可靠性。         

扫描二维码推送至手机访问。

版权声明:本文由激石Pepperstone发布,如需转载请注明出处。

本文链接:http://www.paraat.net/news/3827.html

标签: Alphafold-3
分享给朋友:

“王炸开源!谷歌开源诺奖化学模型Alphafold-3,一夜改变世界!” 的相关文章

腾讯大股东为何“违背承诺”也要减持?

腾讯大股东为何“违背承诺”也要减持?

激石Pepperstone(http://www.paraat.net/)报道:6月27日午间,腾讯公告称大股东Prosus(南非报业Naspers的子公司,握有公司国际互联网资产)将减持公司股份为一项“长期、开放式”回购凑集资金。 这是Prosus第三次减持腾讯持股,最近一次减持是在去年4月,当时...

激石Pepperstone:全球第一场“现代”信贷危机,发生在250年前

激石Pepperstone(http://www.paraat.net/)报道:1772年6月,一个银行家负债潜逃,从而在英国引爆了一场金融风暴,并迅速蔓延到欧洲大部分地区。 这场持续了一年多的金融危机并不那么知名,但却具有重要的历史意义。就私营部门信贷和金融产品在其中扮演的角色、传播最初冲击的金融...

港股低开高走 汽车教育回暖 商汤股份解禁暴跌40%

港股低开高走 汽车教育回暖 商汤股份解禁暴跌40%

激石Pepperstone(http://www.paraat.net/)报道:6月的最后一个交易日,港股低开,恒指开跌0.36%,恒生科技指数开跌0.69%。 随后,恒指和恒生科技指数双双转涨。盘面上,汽车股和教育股回暖。 汽车股回暖,理想汽车涨超5%,蔚来涨近4%,吉利汽车涨近3%。 教育...

经济日报评论:新能源不是20年前的房地产

激石Pepperstone(http://www.paraat.net/)报道: 在近日举行的2022年新能源汽车产业链投资年会上,有经济学家表示,当下新能源相关的产业是未来最有希望、最具爆发力的领域。从长远看,当下不投新能源,就像20年前没买房。这种观点似乎点燃了投资者的热情,本处于反弹阶段的A...

一个时代的终结:Naspers、软银各自从腾讯、阿里抽身

一个时代的终结:Naspers、软银各自从腾讯、阿里抽身

激石Pepperstone(http://www.paraat.net/)报道: 一则公告打掉腾讯4400亿港元市值。 这个“砸盘”方叫Naspers。 6月27日午间,腾讯控股公告称,其主要股东Prosus(该公司由Naspers拥有大多数股权)及Naspers将开启一项长期、开放式的回购计...

AI能run出first in class新药吗?

AI能run出first in class新药吗?

激石Pepperstone(http://www.paraat.net/)报道:2020年11月30日,人工智能程序AlphaFold2在蛋白质结构预测大赛CASP 14中,取得了与冷冻电镜解析结果几乎难以辨别的超高原子水平的精确度,引起药物研发领域的广泛关注,创业融资潮此起彼伏。全球也已经有数十款...